Есть ли возможность применить тему оформления для каждой категории файлов?

Да, у вас есть возможность определить:

• Используйте тему по умолчанию во всех плагинах с предопределенными параметрами (цвета, размер файла отображения и т. д.)
• Выберите тему оформления для каждой категории и определите параметры из выбранной категории

Если плагином пользуются несколько пользователей, то в первом случае лучше придерживаться схожей структуры файлов на всех ваших сайтах WordPress.