Oi,
eu não conheço o Search WP Engine, mas mesmo se usarmos o tipo de postagem padrão para salvar WP File download , não tenho certeza se ele será indexado como deveria.
Não encontrei nenhuma documentação sobre isso, então não posso te dizer.
Você não terá a mesma estrutura entre WPFD e WPMF, eles gerenciam arquivos de forma diferente.
Eu acho que o fato de você querer usar o plugin de pesquisa WPEngine reduzirá muito suas possibilidades.
Eu não falo apenas pelos nossos plugins, você pode ter o mesmo problema com outros plugins que não serão indexados por este mecanismo de busca dedicado e específico. Desculpe, tenho certeza de que não era a resposta que você esperava.
Atenciosamente
Damien