Perguntas sobre recursos e abordagem mais fácil para migrar + proteger os arquivos existentes no local

Olá,

estou tentando proteger meus PDFs e outros arquivos em todo o meu site. Espero que Dropfiles seja a solução.

Tenho algumas dúvidas sobre a extensão...

1. Existe alguma maneira de importar arquivos em massa de um diretório específico? (por exemplo, pesquisar em um conjunto de diretórios ou recursivamente a partir de um ponto inicial) (Imagino que sim, mas quero ter certeza absoluta)
2. Depois de importar os arquivos para Dropfiles , existe uma maneira fácil de pesquisar e substituir todas as Dropfiles ? Pensei que teria que fazer isso no nível do banco de dados do Joomla e criar um script.
3. A URL que eu passo para Dropfiles (depois de concluir o item 2 acima) é "transparente" para o usuário, sem que ele precise acessar páginas adicionais? (Vamos supor que eu defina as permissões apropriadas para os arquivos, obviamente)

Estou procurando a maneira mais fácil de proteger os arquivos do meu site no menor tempo e com o mínimo de esforço.

Agradeço antecipadamente!