検索エンジンにリストされているファイルの制御が必要

カテゴリーを非公開にすれば、検索エンジンから隠されるのは理解できます。カテゴリーが表示されているページからユーザーがクリックしなければファイルに直接リンクできないようなファイルへの直接リンクをブロックするnofollow機能や、何らかのブロック機能があれば便利です。これは有効ですし、管理者がオン/オフを切り替えられる機能があれば、ログインなしで特定のカテゴリーを保護できます。